二代测序RRBS
其中pSpCas9(BB)-2A-GFP 100ng, 根据浓度调整体积。连接1hr。
设计对照,对照同上,只是不加oligo。
连接反应条件如下:
连接反应结束后,推荐使用PlasmidSafe exonuclease去除线性DNA残基,该步骤可选,但强烈建议该步操作。
37 °C 30 min, 70 °C 30 min。之后保存到-20°C,可保存至少一周。
该步骤结束后的产物可直接用于转化大肠杆菌,推荐使用Stbl3感受态。采取热击的方法:取2ul PlasmidSafe后的质粒,加入到20ul感受态中,冰上10min,热击42 °C,30 s,立即置于冰上2min,加入100ul SOC,直接涂板。使用含有Amp100的LB平板。37°C过夜。第二天观察,对照板应无克隆,而含sgRNA插入的板中长有克隆。
挑取单克隆摇菌,用QIAprep spin miniprep kit进行质粒提取。用U6-Fwd primer做为测序引物测序。
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