二代测序RRBS
建到pUC19当中,成为双载体系统。
a.PCR扩增sgRNA表达结构。
PCR体系如下:
U6-Fwd: GAGGGCCTATTTCCCATGATTCC
U6-Rev:AAAAAAAGCACCGACTCGGTGCCACTTTTTCAAGTTGATAA CGGACTAGCCTTATTTTAACTTGCTATTTCTAGCTCTAAAA c NNNNNNNNN NNNNNNNNNNCCGGTGTTTCGTCCTTTCCACAAG(N即与target site反向互补配对的片段)
其中聚合酶也可以使用pfu或者Kapa Hifi代替,高保真聚合酶即可,U6模版推荐使用pSpCas9(BB)。
PCR反应条件如下:
该程序固定,不推荐更改。
PCR结束后,2%琼脂糖凝胶电泳验证,5ul PCR产物,15 V cm–1,30分。条带位置为370bp。
PCR产物用QIAquick PCR purification kit纯化,依照试剂盒说明,最终取35ul EB buffer,或者水进行回收。。
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