马氏珠母贝育珠和生长性状与相关基因的关联分析 - 图文(8)

马氏珠母贝育珠和生长性状与相关基因的关联分析

A B

C D

E F

图4-1 马氏珠母贝四个生长相关基因5’和3’片段扩增产物电泳图（A-F） Fig. 4-1 Electrophoresis of four growth related genes 5 'and 3' fragment

amplification productions from P. martensii (A - F)

4.3.2 生长相关基因的序列分析

通过RACE技术得到了四个与马氏珠母贝生长相关的基因的cDNA全长，通过

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广东海洋大学硕士学位论文

软件预测了解基因的基本特征：

（1）TβR I（转化生长因子-β受体I型）全长为2210bp，5’ UTR为45bp，3’ UTR为596bp，包括27个poly(A)尾巴，开放阅读框（ORF）1569bp，编码522个氨基酸。在线软件预测蛋白质的等电点（PI）为8.70，分子质量为59.74KD；TβR I由信号肽（1-22aa）、细胞外区（23-133aa）、跨膜区（134-156aa）和细胞内区（157-522aa）四部分组成；在23-106aa处有激活素I型受体区，在189-215 aa处存在GS motif，在217-508aa有蛋白酶结构域，如图4-2A和4-2B所示。

（2）EGFR（表皮生长因子受体）全长为4934bp，5’ UTR为250bp，3’ UTR为250bp，包括28个poly(A)尾巴，开放阅读框（ORF）4269bp，编码1422个氨基酸，在线软件预测蛋白质的等电点（PI）为6.19，分子质量为159.76KD；由N端的细胞外区（1-803aa）、跨膜区（804-826aa）和C端的细胞内区（827-1422aa）三部分组成；细胞外区包含两个可以形成β螺旋的富含亮氨酸的结构域（9-127aa和322-441aa），三个可以形成二硫键的富含半胱氨酸的结构域（133-300aa、469-595aa、613-715aa）；细胞内区包含一个酪氨酸激酶区（872-1128aa），如图4-3A和4-3B所示。

（3）生长激素诱导的跨膜蛋白（GHITM）全长为1468bp，5’ UTR为62bp，3’ UTR为389bp，包括27个poly(A)尾巴，开放阅读框（ORF）1017bp，编码338个氨基酸，在线软件预测蛋白质的等电点（PI）为9.87，分子质量为35.48KD，在113-329aa处存在Bax1-I结构域，如图4-4所示。

（4）成纤细细胞生长因子18（FGF18）全长为2534bp，5’ UTR为248bp，3’ UTR为1572bp，包括29个poly(A)尾巴，开放阅读框（ORF）714bp，编码237个氨基酸，包含N端（1-24aa）24个氨基酸残基的信号肽，在线软件预测蛋白质的等电点（PI）为11.28，分子质量为28.09KD，蛋白在45-178aa处存在FGF家族共有的结构域，如图4-5所示。

四个基因的cDNA全长已经提交到GeneBank，登录号：KJ579133（TβR I），KJ579134（EGFR）， KJ579135（GHITM），KJ579136（FGF18）。

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图4-2A 马氏珠母贝TβR I cDNA序列及编码的氨基酸序列

Fig. 4-2A The full length cDNA and amino acid sequence of TβR I from P. martensii

左边的数字表示核苷酸和氨基酸的位置，有框的核苷酸分别表示起始密码子和终止密码子，斜体：信号肽(1-22aa)，横线：激活素受体结构域(23-106aa)，波浪线：跨膜区，小段线：细胞外区，灰色底纹：CCX5C结构 Numbers on the left represents the position of the nucleotide and amino acid, respectively, nucleotide with a frame represents start codon and the stop codon, in italic: signal peptide (1-22 aa), horizontal: Activin receptor domain( 23-106 aa), wavy lines: the transmembrane region, small pieces of wire: extracellular region, shades of gray: CCX5C structure.

图4-2B 马氏珠母贝TβR I蛋白质结构示意图

Fig. 4-2B Protein structure diagram of TβR I from P. martensii

Activin receptor: 激活素受体区(23-106 aa), GS motif: GS 模板(189-215 aa),

Protein Kinase domain: 蛋白酶结构域(217-508 aa)

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