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[gbk] 鲍曼不动杆菌检测分析手册[1]

来源:网络收集 时间:2019-03-04 下载这篇文档 手机版
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鲍曼不动杆菌检测分析手册

一、 分类和基因组特征

鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)属于莫拉氏菌科(Moraxellaceae),不动杆菌属,不动杆菌属命名于1986年,基于DNA-DNA杂交试验,已有21个基因种(genomospecies)被确定 (4,32) ,其中只有7种有正式的命名。鲍曼不动杆菌属于基因种2,是不动杆菌属中临床最常见的一种。

目前为止完成全基因组测序的鲍曼不动杆菌共有3株,多重耐药株AYE、全敏感株SDF、ATCC17978 (10,31) ,其基因组信息见表1-1。多重耐药株AYE携带3个质粒,但是令人惊讶的是这3个质粒没有携带任何已知的耐药相关基因。在AYE染色体中共有52个基因被预测与抗性相关(其中只有7个在SDF中也有分布),其中有45个抗性基因紧密地集合在一个86kb的抗性岛中,是目前发现的最大的抗性岛 (10) 。该抗性岛打断了一个“putative ATPase”读码框,该插入位点在SDF也发现伴有插入(19.6kb—25ORFs),都伴随着“ACCGC”的同向重复。目前为止AYE和SDF的基因组序列还没有在网上公布,关于这两个基因组的其他信息还有待进一步公布。

表1-1 测序株基因组信息

菌株号 基因组大小 G+C含量 AYE SDF

3.9Mb 3.2Mb

38.8% 38.2%

携带质粒大小 5,9,and 94 kb 6 kb,25 kb

基因组岛 86kb抗性岛 19.6kb基因岛

ATCC17978 3.9Mb 38.9% 13.4kb,11.3 kb 28个(16个毒力相关)

二、 临床特征

鲍曼不动杆菌为条件致病菌,一般认为对健康个体不致病,但可使虚弱个体感染。可以引起肺炎、烧伤感染、伤口感染、脑膜炎、尿路感染、腹膜炎、心内膜炎、骨髓炎、关节炎等,并可进一步发展为败血症。鲍曼不动杆菌感染往往存在混合感染,如19%~35%的败血症病例为多菌感染 (29) ,所以临床表现不典型。

1.肺部感染 就感染来源而言,既有外源性感染,又有内源性感染。口咽部菌体的吸入,很可能是内源性感染的主要发病机制。常有发热、咳嗽、胸痛、气急及血性痰等表现。肺部可有细湿啰音。肺部影像常呈支气管肺炎的特点,亦可为大叶性或片状浸润阴影,偶有肺脓肿及渗出性胸膜炎表现。

2.伤口及皮肤感染 手术切口、烧伤及创伤的伤口,均易继发不动杆菌皮肤感染,或与其他细菌一起造成混合感染。临床特点与其他细菌所致感染并无明显不同。多无发热。偶可表现为蜂窝织炎。

3.泌尿生殖系统感染 不动杆菌可引起肾盂肾炎、膀胱炎、尿道炎、阴道炎等,亦可呈无症状菌尿症,但临床上无法与其他细菌所致感染区别,其诱因多为留置导尿、膀胱造瘘等。

4.菌血症 菌血症为不动杆菌感染中最严重的临床类型,病死率达30%以上。多为继发于其他部位感染或静脉导管术后,少数原发于输液、包括输注抗生素、皮质类固醇、抗肿瘤药物等之后。有发热、全身中毒症状、皮肤瘀点或瘀斑以及肝脾肿大等,重者有感染性休克。少数可与其他细菌形成复数菌菌血症。 5.脑膜炎 脑膜炎多发于颅脑手术后。有发热、头痛、呕吐、颈强直、凯尔尼格征阳性等化脓性脑膜炎表现。

鲍曼不动杆菌感染部位主要是下呼吸道,多见于胸肺部手术、机械通气患者、

年老体弱者,其次是手术创口及泌尿系统感染。医院内鲍曼不动杆菌感染主要集中于重症监护病房,重症监护病房鲍曼不动杆菌感染又主要集中于呼吸科。

近几年来由于多重耐药菌株的迅速增加,鲍曼不动杆菌已经在全世界成为最难以治疗和控制的院内获得性感染 (16) 。

四、 流行病学特征

不动杆菌在自然界广泛存在,土壤和淡水样本中几乎都可以分离到不动杆菌 (2) 。在医院内的加湿器、呼吸机、医务人员皮肤、床垫、枕头等物品表面也可分离到不动杆菌 (7,30,37) 。有研究发现,在家具的塑料贴膜表面,鲍曼不动杆菌可存活25 天 (14) ,而其他的革兰阴性杆菌如大肠埃希菌和铜绿假单胞菌的存活时间均少于24 小时。不动杆菌不仅在自然界广泛存在,还经常在动物和人类的皮肤表面定植。一般认为,由于其在皮肤表面的定植,医务人员通过手的

接触可造成该菌的污染和扩散。不动杆菌在物体表面和体表的持续存活,是其成为

医院感染病原菌的重要条件。

鲍曼不动杆菌还具有显著的快速建立耐药性的能力,几十年内就可以建立多重耐药 (2) ,其中的部分菌株甚至对目前所有已知的抗生素均耐药 (36) 。在20世纪70年代左右,鲍曼不动杆菌还对大部分抗生素均敏感,但由于抗生素的广泛使用,鲍曼不动杆菌获得了广泛的耐药。由于鲍曼不动杆菌具有在干燥环境的生存能力,及快速获得耐药性的能力,现已在世界范围内成为院内感染的主要病原体。在欧洲,鲍曼不动杆菌在ICU(intensive care units)病房内引发的院内感染占到了革兰氏阴性菌感染的2%~10% (12) ,而美国则占到了2.5% (17) 。随着耐药菌株的日益增多,鲍曼不动杆菌感染已经成为许多国家重要的公共卫生问题。由于感染A. baumannii的病人往往已经患病严重或者免疫抑制,所以继发感染多重耐药A. baumannii后往往致死率会大大提高,有文献报道重症监护病房病人感染抗性不动杆菌后死亡率会提高3倍左右 (24) 。

不动杆菌是条件致病菌,好发于病情严重、免疫力低下的患者,医院感染多于社区获得性感染。只有了解不动杆菌感染的危险因素,才能有针对性地采取防止其定植和感染的措施。目前已证实的危险因素主要包括:严重基础疾病、既往感染或败血症、长时间使用呼吸机、抗生素(特别是三代头孢菌素和碳青霉烯类)治疗史、不动杆菌体表定植史、长期在ICU 病房住院、静脉插管、创伤性诊疗措施、静脉高营养和粒细胞减少等 (2,15,19) 。这些因素同样也是许多其他革兰阴性杆菌感染的危险因素,并非不动杆菌所特异,但有报道认为鲍曼不动杆菌的流行与抗生素的压力关系密切 (6) 。

鲍曼不动杆菌感染的流行病学特征总结如下:

1.传染源:绝大多数为医院获得性感染,污染的院内环境、医疗器械、人员的携带均可构成传染源。

2.传播途径及传播条件:虽然鲍曼不动杆菌广泛存在于自然界和医院环境,但其储存库和感染源主要是医院环境和物件(包括各种医疗设备、空调、湿化装置等)以及住院患者。主要传播途径为接触传播和空气传播,一般认为不动杆菌对健康个体是不致病的,但可使虚弱个体感染。危险因素包括抗生素处理,外科手术,使用侵入性仪器及ICU病房的长期滞留等。

3.易感性:鲍曼不动杆菌为条件致病菌,广泛存在于自然界和体表,一般认为健康个体不易感,但高龄、免疫抑制、外伤、长期接收抗生素治疗、接受侵入性医疗过程、长期住院或ICU病房滞留的患者易感。

4.流行特征:鲍曼不动杆菌感染的流行没有明显发病季节,一年四季均可发病。 绝大多数为医院获得性感染。危险因素主要与患者病情严重程度、治疗干预强度、免疫力、基础心肺功能、接受多种侵袭性操作、机械通气、广谱抗生素使用等有关,这些决定了它在院内的分布以ICU、血液、移植、烧伤等病房多见。它主要引起医院获得性肺炎尤其是呼吸机相关性肺炎、菌血症、尿路感染、脑膜炎等,其中在机械通气患者中引起的下呼吸道感染已越来越受临床的关注。

六、 菌株保存

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