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生物信息学结课论文
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有助于理解蛋白质结构与功能之间的相关性。使用SWISS PDB Viewer分析该蛋白质序列的三级结构。
图11.1 蛋白质三维结构图
结果表明:
该蛋白质有5个β转角区域以及一些无规则卷曲，没有α螺旋区域。
参考文献
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表12.1检索工具表
功能
BLAST检索 开放阅读框分析 同源性分析Pairwise blastp 同源性分析emboss_needle 同源性分析emboss_water 蛋白质序列理化性质分析 信号肽分析工具 跨膜区域分析 蛋白质三级结构预测
网址
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/orfig.cgi http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/BlastAlign.cgi https://www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_needle/ https://www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_water/ http://web.expasy.org/protparam/
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-3.0/
http://www.sbc.su.se/miklos/DAS/
http://swissmodel.expasy.org/
蛋白质结构与分析 http://prosite.expasy.org/scanprosite/ 蛋白质亲疏水性分析 http://web.expasy.org/cgi-bin/protscale/protscal/ 本地生物信息学分析软件:MEGA5.2、Primer5.0、SWISS PDB Viewer
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