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马氏珠母贝育珠和生长性状与相关基因的关联分析 - 图文

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分类号:Q71 U D C :577 密 级 :

学 号 :2111101109

广 东 海 洋 大 学

硕士学位论文

马氏珠母贝育珠和生长性状与相关基因

的关联分析

陈伟耀

指导教

师: 杜晓东 教授 申请学位类别: 理学硕士 专研学

业究院

名方名

称: 海洋生物学 向: 海洋经济动物发育学 称: 水产学院

中国·湛江 2014年6月

马氏珠母贝育珠和生长性状与相关基因

的关联分析

摘 要

本研究以马氏珠母贝选育系F5、对照群体和普通养殖群体为实验材料,比较了三个群体育珠和生长性状的差异,分析了矿化和生长基因与相关性状的关联性,且克隆并分析了4个生长相关基因,结果如下:

1、植核手术后经过7个月的海区养殖,比较三个群体的育珠性能:(1)选系F5比对照群体和普通养殖群体的成活率分别提高了8.79%和7.61%;(2)选系F5比对照和普通养殖群体的留核率分别提高了47.94%和46.06%,差异显著(P < 0.05);(3)选系F5的珍珠质重量比对照群体和普通养殖群体分别提高了22.02%、18.75%,差异不显著;选系F5的珍珠层厚度比对照群体和普通养殖群体分别提高了30.24%、 24.28%,差异显著(P < 0.05);

2、植核育珠第210天,育珠性状和矿化基因的相关性分析结果表明:NACREIN、MSI60和PIF177与珍珠性状呈正相关,相关系数为0.408-0.979;而N19与珍珠性状呈负相关,N19与珍珠层厚度和珍珠质重量相关系数分别为-0.214和-0.270;

3、从本实验室珍珠囊转录组数据库筛选出四个生长相关基因,转化生长因子β受体I型(TβR I)、表皮生长因子受体(EGFR)、生长激素诱导的跨膜蛋白(GHITM)和成纤细胞生长因子(FGF18),分析这些基因与生长性状的相关性。四个生长相关基因(TβR I,EGFR,GHITM,FGF18)与马氏珠母贝壳长、壳高等8个生长性状均呈正相关,相关系数为0.387-0.998,其中TβR I与壳长的相关水平显著(r = 0.998,P < 0.05)。

4、马氏珠母贝TβR I基因cDNA全长2210bp,ORF为1569bp,编码522个氨基酸,蛋白前体由信号肽、细胞外区、跨膜区和细胞内区四部分组成。细胞外区包含一个激活素I型受体区,细胞内区包括GS结构域(189-215aa)和丝氨酸/苏氨酸激酶结构域(217-508aa);马氏珠母贝EGFR基因cDNA全长4934bp,ORF为4269bp,编码1422个氨基酸。蛋白由N端的细胞外区、跨膜区和C端的细胞内区三部分组成,细胞外区是配体的结合位点,跨膜区由22个氨基酸残基组成,将受体锚定在胞膜上;细胞内区包含一个酪氨酸激酶区(872-1128aa);马氏珠母贝GHITM基因cDNA全长1468bp,ORF为1017bp,编码338个氨基酸,与Bax1-I家族共有217aa结构域;马氏珠母贝FGF18基因的cDNA全长为2534bp,ORF为714bp,编码237个氨基酸,蛋白质前体有N端信号肽结构,成熟蛋白由213个氨基酸残基构成,在45-178aa处存在FGF家族共同的保守序列;氨基酸序列同源比对发现TβR I、GHITM和EGFR具有较强保守性,在软体动物和脊椎动物中同源性亦较高,而FGF18保守性相对较

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