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总RNA的提取定量与RT-PCR(2)

来源:网络收集 时间:2021-09-24 下载这篇文档 手机版
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(6)于70℃加热15 min以终止反应,将管插入冰中。

3.PCR:[本次实验采用Premix Taq Version2.0(Loading dye mix)试剂]

(1)取0.5ml PCR管,依次加入下列试剂:第一链cDNA 2 μl 、上游引物(10pmol/L)2 μl 、下游引物(10pmol/L)2 μl 、dNTP(2mmol/L) 4 μl 、10×PCR buffer 5 μl 、Taq酶(2U/μl) 1 μl 。 (2)加入适量的ddH2O,使总体积达50 μl。轻轻混匀,离心。

(3)设定PCR程序。在适当的温度参数下扩增28-32个循环。为了保证实验结果的可靠与准确,可在PCR扩增目的基因时,加入一对内参(如G-3-PD)的特异性引物,同时扩增内参DNA,作为对照。 (4)电泳鉴定:进行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察结果。 (5)结果分析:采用凝胶图像分析系统,对电泳条带扫描分析。

四、实验注意事项

1、本实验大部分为RNA操作,注意RNA酶的污染。

2、快速的操作,低温环境,少量取上清 主要是抽提之后吸取上清时要特别小心,只要不把蛋白层吸出来就不会有RNase污染。

3、加样原则是酶最后加,其他试剂按照体积大小从大往小的加。

南医实验报告

【实验记录】 一、 实验条件

见第一、第二部分。 二、 实验现象

1、 琼脂糖凝胶电泳图像:

从凝胶电泳的图像上看,本组的反转录DNA条带可以看到与MARKER带对应的特异性条带,但特异性不明显,也出现了弥散或非特异性条带。

南医实验报告

【结果与讨论】

一、结果 如上图所示。 三、

讨论

(1)特异性反转录DNA条带不明显, 且有弥散或非特异性条带,说明在总RNA的提取上存在缺陷,导致RNA提取量不足且反转录产生其他DNA片段。 具体原因可能包括 1)

多种原因导致RNA降解或断裂,如操作时间过长,存在污染物,实验中

保存温度过高,溶液或离心管未经RNase去除处理,细胞在用酶处理时过度等 2) 3) 4)

细胞裂解不充分,RNA提取量不足 吸取RNA上清液时存在少量DNA杂质 RNA提取时未完全溶解,导致RNA量不足

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