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CASTEP概述

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CASTEP概述

关于CASTAP

CASTAP是特别为固体材料学而设计的一个现代的量子力 学基本程序,其使用了密度泛函(DFT)平面波赝势方法,进行 第一原理量子力学计算,以探索如半导体,陶瓷,金属,矿物 和沸石等材料的晶体和表面性质。 典型的应用包括表面化学,键结构,态密度和光学性质等 研究, CASTAP也可用于研究体系的电荷密度和波函数的3D形 式。此外, CASTAP可用于有效研究点缺陷(空位,间隙和置 换杂质)和扩展缺陷(如晶界和位错)的性质。 Material Studio使用组件对话框中的CASTAP选项允许准 备,启动,分析和监测CASTAP服役工作。 计算:允许选择计算选项(如基集,交换关联势和收敛判据), 作业控制和文档控制。 分析:允许处理和演示CASTAP计算结果。这一工具提供加速整 体直观化以及键结构图,态密度图形和光学性质图形。

CASTAP的任务CASTAP计算是要进行的三个任务中的一个,即单个点的能量计算, 几何优化或分子动力学。可提供这些计算中的每一个以便产生特定的 物理性能。性质为一种附加的任务,允许重新开始已完成的计算以便 产生最初没有提出的额外性能。 在CASTAP计算中有很多运行步骤,可分为如下几组: * 结构定义:必须规定包含所感兴趣结构的周期性的3D模型文件,有 大量方法规定一种结构:可使用构建晶体(Build Crystal)或构建真 空板(Build Vacuum Stab)来构建,也可从已经存在的的结构文档中 引入,还可修正已存在的结构。 注意: CASTAP仅能在3D周期模型文件基础上进行计算,必须构建超 单胞,以便研究分子体系。 提示: CASTAP计算所需时间随原子数平方的增加而增加。因此,建 议是用最小的初晶胞来描述体系,可使用Build\Symmetry\Primitive Cell菜单选项来转换成初晶胞。

* 计算设置:合适的3D模型文件一旦确定,必须选择计算类型 和相关参数,例如,对于动力学计算必须确定系综和参数,包 括温度,时间步长和步数。选择运行计算的磁盘并开始CASTAP 作业。 * 结果分析:计算完成后,相关于CASTAP作业的文档返回用 户,在项目面板适当位置显示。这些文档的一些进一步处理要 求获得可观察量如光学性质。 CASTAP中选择一项任务 1 从模块面板(Module Explorer)选择CASTAP\Calculation。 2 选择设置表。 3 从任务列表中选择所要求的任务。

CASTAP能量任务

CASTAP能量任务允许计算特定体系的总能量以及物理性质。除了总能量之外,在计算之后还可报告作用于原子上的力;也 能创建电荷密度文件;利用材料观测仪(Material Visualizer)允许目测电荷密度的立体分布;还能报告计算中 使用的Monkhorst-Park的k点的电子能量,因此在CASTAP分

析 中可生成态密度图。 对于能够得到可靠结构信息的体系的电子性质的研究,能量任 务是有用的。只要给定应力性质,也可用于计算没有内部自由 度的高对称性体系的状态方程(即压力-体积,能量-体积关 系)。

注意:具有内部自由度的体系中,利用几何优化(Geometry Optimization)任务可获得状态方程。CASTAP中能量的缺损单位是电子伏特(eV),各种能量单位的换 算关系见Mohr.P.J(2000). 1 eV=0.036749308 Ha=23.0605 kcal/mole=96.4853 kJ/mole

CASTAP几何优化任务CASTAP几何优化任务允许改善结构的几何,获得稳定结构 或多晶型物。通过一个迭代过程来完成这项任务,迭代过程中 调整原子坐标和晶胞参数使结构的总能量最小化。 CASTAP几何优化是基于减小计算力和应力的数量级,直到 小于规定的收敛误差。也可能给定外部应力张量来对拉应力、 压应力和切应力等作用下的体系行为模型化。在这些情况下反 复迭代内部应力张量直到 与所施加的外部应力相等。

几何优化处理产生的 模型结构与真实结构紧密 相似。利用CASTAP计算的 晶格参数精度列于右图。

状态方程计算 在所施加静压力下几何优化可用于确定材料的体模量B和对压力 的导数B‘=dB/dP。过程包括计算理论状态方程(EOS),该方程描 述单胞体积与外部静压力的关系。工艺非常类似于真实实验:使 用几何优化对话框中的应力列表将外部压力固定。通过进行几何 优化可以找到在此压力下的单胞体积。随后的P-V 数据分析与实 验研究精确一致。描述EOS选择分析表达式,其参数适于计算数 据点。最流行的EOS形式是三阶Birch-Murnaghan 方程: P-V 式中V0 为平衡体积。Cohen 等进行了EOS各种解析式的的 详细比较研究。 注意:从相应实验中获得的B和B‘值依赖于计算使用的压力值范 围。利用金刚石压砧获得的实验值通常在0-30GPa范围内,因此 推荐理论研究也在这个范围内。在研究中避免使用负压力值也 很重要。此外,用于生成P-V 数据序列的压力值可能是不均匀 的,在低压力范围要求更精确采样以便获得体模量精确值。

几何优化方法 在默认条件下,CASTAP使用BFGS几何优化方法。该方法通 常提供了寻找最低能量结构的最快途径,这是支持CASTAP单 胞优化的唯一模式。 衰减分子动力学( Damped molecular dynamics)方法是 另一种可以选择的方法,该方法对具有平滑势能表面的体系如 分子晶体或表面分子与BFGS同样有效。

CASTAP动力学任务CASTAP动力学任务允许模拟结构中原子在计算力的影响下将如何移动。 在进行CASTAP动力学计算以前,可以选择热力学系综和相应参数,定义模拟 时间和模拟温度。

选择热力学系综对牛顿运动

定律积分允许探索体系恒值能量表面(NVE动力学)。然而,在 体系与环境进行热交换条件下发生最本质的现象。使用NVT系综(或者是确定性 的Nosé 系综或者是随机性的Langevin 系综)可模拟该条件。

定义时间步长(timestep )

在积分算法中重要参数是时间步长。为更好利用计算时间,应使用大的时间步长。 然而,如果时间步长过大,则可导致积分过程的不稳定和不精确。典型地,这表 示为运动常数的系统偏差。 注意:量子力学分子动力学计算要求比力场动力学使用更小的时间步长。

动力学过程的约束CASTAP支持Langevin NVT或NVE动力学过程的线性约束。然而,借助Material Studio界面可以近似使用以下两种更基本的约束: 质心固定,单个原子固定。 使用seedname.cell 文档可以利用更复杂的约束。

CASTAP性质任务CASTAP性质任务允许在完成能量,几何优化或动力学运行之后求出电 子和结构性质。可以产生的性质如下:

* 态密度(DOS):利用原始模拟中产生的电荷密度和势能,非自恰计算价 带和导带的精细Monkhorst-Pack 网格上的电子本征值。* 带结构:利用原始模拟中产生的电荷密度和势能,非自恰计算价带和导 带的布里渊区高对称性方向电子本征值。 * 光学性质:计算电子能带间转变的矩阵元素。CASTAP分析对话可用于生 成包含可以测得的光学性质的网格和图形文件。 * 布局数分析:进行Mulliken 分析。计算决定原子电荷的键总数和角动量 (以及自旋极化计算所需的磁矩)。任旋地,可产生态密度微分计算所要 求的分量。 * 应力:计算应力张量,并写入seedname.castep 文档。

如果要进行单胞参数固定时进行几何优化运行和要检查点 阵偏离平衡的程度,这些信息是有用的。例如,可进行符合于 给定体系理论基态的固定单胞的点缺陷的超晶胞研究。几何优 化后的应力值显示了与超单胞近似相关联的弹性效应。 注意:为计算某种性质,从适当模拟得到的结果文档必须以当 前的文件夹形式出现。

用第一原理预测AIAs的晶格参数

本指南主要是阐明在Materials Studio当中 如何运用量子力学来测定物质的晶体结构。 你将从中学到如何构建晶体结构以及如何设 置CASTEP几何优化运行和分析结果。 本指南的内容如下: 1. 构建AlAs的晶体结构 2. 设置和运行CASTEP中的计算 3. 分析结果 4. 比较实验数据和结构 注意: 如果你的服务器没有足够快的CPU, 本指南限制使用CASTEP进行几何优化计算, 因为它会占用相当长的时间 。

1.

构建AlAs的晶体结构

空间群是F-43mAl的分数坐标:(0 0 0) (1/2 1/2 0) (1/2 0 1/2) (0 1/2 1/2) As的分数坐标:(3/4 3/4 3/4) (1/4 1/4 3/

4) (1/4 3/4 1/4) (3/4 1/4 1/4)

(1/4 3/4 1/4)

(3/4 3/4 3/4)

(1/2 1/2 0) (3/4 1/4 1/4)

(0 1/2 1/2) (1/4 1/4 3/4) (0 0 0) (1/2 0 1/2)

As:

(3/4 3/4 3/4)= (1/4 1/4 1/4)

为了构建晶体结构,我们需要知道你想要构建的晶体 的空间群信息,晶格参数以及它的内部坐标。以AlAs为例, 它的空间群是F-43m或空间群数字是216。它有两种基本元 素 Al 和 As , 其 分 数 坐 标 分 别 为 ( 0 0 0 ) 和 ( 0.25 0.25 0.25)。它的晶格参数为5.6622埃。 第一步是构建晶格。在Project explorer的跟目录 上右键单击,选中New | 3D Atomistic Document。接着 在3D Atomistic Document右键单击,把它更名为AlAs。 从菜单中选择Build | Crystals | Build Crystal, 然后显示出Build Crystal对话框,如下:

在Enter group中选择 F-43m或在Enter group中 单击,然后键入216,再 按下TAB键.(空间群信息 框中的信息也随着F-43m 空间群的信息而发生变 化 )

选择Lattice Parameters标签, 把a的数值从10.00改为5.662。 单击Build按钮。

一个没有原子 的晶格就在3D model document中 显示出来。

单击此图标, 然后可旋转 晶格,显示 其立体结构。

从菜单栏中选择Build | Add Atoms。通过它,我们可以把原子添 加到指定的位置,其对话框如下:

在Add Atoms对话框中选择Options标签,确定Coordinate system为Fractional。如上所示。选择Atoms标签,在Element文 本框中键入Al,然后按下Add按钮,铝原子就添加到结构中了。

单击此图标, 出现添加原子 Add Atoms 对话框。选择 原子名称,输 入分数坐标, 按Add,则原 子添加到晶体 结构图中。重 复操作,直到 添加完晶胞中 的所有原子。 关闭Add Atoms框。

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