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肿瘤个体化治疗相关基因突变检测试剂技术审查指导原则(11月)(3)

来源:网络收集 时间:2019-04-15 下载这篇文档 手机版
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(2) 最低检测限:试剂盒能够覆盖的所有突变靶序列的最低检出浓度,重点考虑原始模板中突变基因的百分率和扩增终体系中核酸浓度两个因素对最低检测限的影响。简单介绍最低检测限的确定方法以及对最低检测限验证所采用的靶序列的信息。

(3) 企业内部阳性/阴性参考品符合率,阳性/阴性参考品的组成、来源、浓度梯度设臵以及评价标准等信息。

(4) 精密度:精密度参考品的组成、来源、浓度梯度要求及评价标准。建议以列表的方式表示不同浓度精密度参考品的检测结果(变异系数)。

(5) 分析特异性

①野生型验证:应采用不同浓度的野生型核酸样本进行验证,其结果应均为阴性。

②试剂盒内交叉反应:如考核试剂包括对多个突变位点的检测,则应对该试剂盒覆盖范围内的所有突变类型间进行交叉反应验证。

③序列相近或具有一定同源性的其他较常见突变或野生型基因序列间的交叉反应验证。

④潜在干扰物质验证。

如果经验证发现某些序列与靶序列的交叉反应出现阳性结果,则应该对存在交叉反应的核酸序列及浓度进行验证并在产品说明书中表明这种假阳性发生的可能,做出相关的

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提示。

(6) 对比试验研究(如有):简要介绍参比试剂(方法)的信息、所采用的统计学方法及统计分析结果。

12. 【注意事项】 应至少包括以下内容:

(1) 如该产品含有人源或动物源性物质,应给出具有潜在感染性的警告。

(2) 临床实验室应严格按照《医疗机构临床基因扩增实验室管理办法》(卫办医政发?2010?194号)等有关分子生物学实验室、临床基因扩增实验室的管理规范执行。 (三) 拟定产品标准及编制说明

拟定产品标准应符合《体外诊断试剂注册管理办法(试行)》和《体外诊断试剂注册申报资料基本要求》的相关规定。另外,对于国产试剂,应参考《中国生物制品规程》(2000年版),将申报产品的主要原材料、生产工艺及半成品检定等内容作为附录附于标准正文后,并在正文的“产品分类”项中引出该附录内容。附录中应将待测靶基因的基因位点、引物/探针设计及来源、参考品设臵、来源及验证情况、各种酶的来源、特性及验证等重点内容予以明确。

肿瘤个体化治疗相关基因突变检测试剂的注册检测应主要包括以下性能指标:物理性状、试剂盒内阴/阳性对照

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品(质控品)的Ct值要求(包括内标)、阴/阳性参考品符合率、精密度、最低检测限等。阳性参考品主要考察对试剂盒覆盖范围内不同突变基因的检测符合性,阴性参考品则重点对申报试剂的分析特异性进行验证。

如果申报试剂已有相应的国家/行业标准发布,则企业标准的要求不得低于国家/行业标准的要求。 (四) 注册检测

根据《体外诊断试剂注册管理办法(试行)》的要求,首次申请注册的第三类产品应该在国家食品药品监督管理局认可的、具有相应承检范围的医疗器械检测机构进行连续3个生产批次样品的注册检测。对于已经有国家标准品的检测项目,在注册检测时应采用相应的国家标准品进行,对于目前尚无国家标准品的项目,生产企业应建立自己的参考品体系并提供相应的内部参考品。 (五) 主要原材料研究资料

应提供主要原材料如引物、探针、企业参考品的选择与来源、制备过程、质量分析和质控标准等相关研究资料。若主要原材料为企业自己生产,其生产工艺必须相对稳定,并提交工艺验证报告;如主要原材料购自其他供货商,应提供的资料包括:对物料供应商审核的相关资料、供货方提供的

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质量标准、出厂检定报告,以及该原材料到货后的质量检验资料。

1. 核酸分离/纯化组分(如有)的主要组成、原理介绍及相关的验证资料。

2. PCR和/或RT-PCR组分的主要原料(包括引物、探针、各种酶及其他主要原料)的选择、制备、质量标准及实验研究资料,主要包括以下内容:

(1) 脱氧三磷酸核苷(dNTP)

核酸的组成成分,包括:dATP、dUTP、dGTP、dCTP和dTTP,对纯度、浓度、保存稳定性等的验证资料。

(2) 引物

由一定数量的dNTP构成的特定序列,通常采用DNA合成仪人工合成,合成后经聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)或其他适宜方法纯化。需提供对分子量、纯度、稳定性、功能性实验等的验证资料。如为外购,应提供合成机构出具的合成产物的质检证明,如PAGE电泳结果或高效液相色谱法(HPLC)分析图谱。

(3) 探针

特定的带有示踪物(标记物)的已知核酸片段(寡聚核苷酸片段),能与互补核酸序列退火杂交,用于特定核酸序列的探测。合成后经聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)或其他适宜方法纯化,在5-端(和/或3-端)进行标记,并经HPLC或

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其他适宜方法纯化,纯度应达到HPLC纯。应提供合成机构出具的合成产物的质检证明,如HPLC分析图谱,应对探针的分子量及标记的荧光素进行核实,并进行功能性试验验证。

(4) 酶

DNA聚合酶,应具有DNA聚合酶活性,无核酸内切酶活性,具热稳定性,如:94℃保温1小时后仍保持50%活性;尿嘧啶糖基化酶(UNG),具有尿嘧啶糖基化活性,无核酸外切酶及核酸内切酶活性,应对酶活性有合理验证;逆转录酶,具逆转录酶活性,无核酸内切酶活性。

3. 核酸类检测试剂的包装材料和耗材应无DNase和RNase污染。

4. 企业内部参考品:应详细说明有关企业内部参考品的原料选择、制备、定值过程等试验资料。具体要求如下:

(1) 阳性参考品

试剂盒(分型或不分型)所能覆盖的所有突变位点均应设臵相应的阳性参考品,每个突变位点设臵至少三个突变百分率梯度,其中需包括至少一份弱阳性参考品。阳性参考品的突变形式及浓度需经过金标准方法或已上市同类分型试剂的确认。

如申报试剂用于DNA样本的检测,则阳性参考品可以采用临床样本提取的DNA储备液、相应质粒或细胞系(如有)

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