NCBI - PMC - 图文(2)

核酸数据库

? International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC)包括 ? GenBank

[美] http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank ? EMBL

[欧] http://www.ebi.ac.uk/embl/

? DDBJ

[日] http://www.ddbj.nig.ac.jp/ ? 每天这三个数据库作数据同步操作

? 在任何一个数据库操作(查找、投递数据等)是等效的 BioSino

? www.biosino.org ? 是中国自主开发的核酸序列公共数据库 ? 发表我国学者提供的核酸序列,并接受注册登记 ? 有CDNAP和DDIB两个产品

? http://www.cdnap.org/ ? http://www.biosino.org/DIDWeb/index.html 蛋白数据库

? 一级(次)序列数据库

? PIR(全面,注释少), MIPS, SWISS-PROT(注释多), TrEMBL, NRL-3D(三维)

? 序列复合数据库: NRDB (NCBI,全,更新快), OWL(

注

释

多

,冗

余

低

),

MIPSX,

SWISS-PROT+TrEMBL(冗余更低) ? 二级(次)序列数据库

? PROSITE (motif,MSA), PRINTS (motifs,MSA), BLOCKS(非正则表达式), Profile(全序列), Pfam (HMM) ? 三级(次)序列数据库: INDENTIFY

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