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SDTMIG学习总结

来源:网络收集 时间:2019-02-15 下载这篇文档 手机版
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CDISC SDTM IG学习笔记

学习心得:

SDTM数据集与一般数据集的区别: 1. 数据集个数不同

按照数据变量的不同来源分为不同的域,而一般的临床试验只有一个或少量几个数据集。

也就是数据不是按照在CRF表中的位置来收集的,而是按不同topic。 2. 个人记录与事件记录

一般数据集每个人一条记录,SDTM数据集每个人的每个事件、每次用药或每次不良反应一条记录。变量的数量减少,记录的条数增多。也就意味着每个受试者每次访视每个时间点可能有许多条观测记录。 3. 由于变量之间存在关联,所以SDTM有关联数据集

4. CDISC的重点是如何确定记录的唯一性,比如多阶段多时间多剂量的试验,就需要有三个变量来区别。

5. 元数据:关于数据的数据,按照一定的标准,从信息资源中抽取出相应的特征,组成一个特征元素集合。包括描述一个具体对象所需要的数据项集合、各项数据语义定义、规则和语法定义。元数据标准的制定为提高数据库建库质量,使诗句加工达到规范化、标准化,促进科学数据标准化,加强数据交流。

6. 作用:变量名标准化,变量取值标准化

7. 并不是所有的域和变量都要使用,根据研究内容来选择

This model describes the contents and structure of data collected during a clinical trial

The purpose is to provide regulatory authority reviewers (FDA) a clear description of the structure, attributes and contents of each dataset and variables submitted as part of a product application

1. 域

1.1 定义:一组具有共同主题并在逻辑上相关的观测结果集合。A domain is defined as a collection of observations that share a common topic.

每个域采用唯一的两字符(英文缩写)代码加以区别,如不良时间域(AE, Adverse Event)

域是SDTM的核心,所有变量按不同的来源被分类到相关的域。比如下图中展示提交的SAS数据集。CM(concomitant and prior medication)伴随用药域、DA(Drug Accountability)药物发放回收记录域和DM(DEMOGRAPHICS)人口学资料域等。

? 域名和变量名是固定不能变的。在所有域中使用SDTM规定的变量标签 ? 研究中只需提交实际采集的域,具体采集哪些数据由研究内容决定,而

不是基于SDTM。

? 扩展内容:如果现有的域不能满足要求,可以创建自定义域(相关内容

未包括)

1.2 域模型

1.2.1 域可以分为五类 Special-Purpose Domains

General Observation Class(3种Interventions,Events, Findings), Finding about, Trial Design

Relationship Datasets。

下图是SDTM vesion3.2中包括的所有域。

1.2.2域模型假设

变量名最长为8个字符

变量筛选:每个域中有各种变量,研究者应按需要选择合适的变量。域中的变量

按照需求的不同可分为必需变量(域中必须有且值不能为空)、预期变量(域中必须有但可以为空值)和许可变量(有数据才提交)

变量顺序:对于General Observation Class中的变量顺序,应先按标识变量、主题变量、修饰语变量到时间变量依次排列,每种变量类型内按照SDTM表中变量描述排序。

扩展内容:域可以被分割,如将调查量表QS域分为临床整体印象(QSCG)、痴呆易于康奈尔量表(QSCS)和细微精神状况检查(QSMM),操作方法不详述。 受试者:在标签或注释中将“病人”或“志愿者”统称为“受试者”。在所有的域数据集中都应该包含唯一的标示符(USUBJID)。一般可用:研究编号、临床中心编号和受试者编号联接起来作为USUBJID。

文本数据大小写:建议大写文字形式递交文本数据(如果是英文的话),长文本或标签文本及已经是大小写的受控术语除外。

缺失值:单个数据项缺失以空来表示,如果有—STAT变量和—REASND变量则还需在—STAT中录入NOT DONE,在—REASND中录入原因。

分类变量:——CAT、——SCAT、——GRPID、——SPID、——REFID ——CAT与——SCAT在采集之前就已知,是固有属性,用于受试者之间分组 ——GRPID通常在数据采集之后由申办者指定,受试者之内分组数据

对各受试者之间具有相同值的数据用——CAT与——SCAT,而对受试者之间具有不同值时用——GRPID

自由文本:其他,请说明。P36页 一个变量的多个取值

受控术语:一个星号*或两个星号**代表相应的变量应该被填入意义明确的一组数值(受控术语)。一个星号表示受控术语来自申办者自定义的值,两个星号表示来自外部已出版的数据源。

? 建议受控术语应大写,除了本来就是小写的或计量单位 ? 放入define.xml ? 不能用数字代码

每个通用观察域必须要有一个主题变量,一个时间变量

主题变量:事件类——TERM,干预类——TRT,发现类——TEST;必须有受控术语

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