1.研究相互作用蛋白质组学的意义？
答：1、蛋白质很少单独执行它们的功能，通常是通过多蛋白复合物执行着重要的生物功能。因此，在全球范围内进行相互作用蛋白（即所谓的相互作用组）的调查研究，对现代分子生物学显得尤为重要。2、对蛋白复合物的剖析能够深刻的了解其分子功能，并且能帮助我们更好的理解发病机制，最终研究出更好的药物靶点。3、蛋白质是细胞的重要组成部分，而它们的相互作用对于大多数细胞功能的发挥是必不可少的。一些基本的生物过程如基因转运，细胞周期控制，信号转导，或调控过程都基于正确的蛋白复合物的功能。后基因组时代的一个重要里程碑是功能性地注释大量累积起来的基因组数据. 2.相互作用蛋白质组学的研究方法有哪些?
答：一般而言，相互作用蛋白质组学的研究方法包括遗传学方法和生物化学方法
遗传学方法：①蛋白质片段互补分析技术 ②膜酵母双杂交技术 ③共振能量传递技术
④发光标记哺乳动物相互作用组定位技术 生物化学方法①免疫共沉淀法 ②串联亲和纯化法
③基于质谱分析的各种生化方法
3.与传统蛋白质相互作用研究方法相比，相互作用蛋白质组学的优势
在哪里？
答：①（MYTH）膜酵母双杂交技术
：不像传统的酵母双杂交系统，膜酵母双杂交系统不需要蛋白质的相互作用发生在细胞核内，因此某些细胞外蛋白和细胞膜受体蛋白等的研究就不受限制了。系统可以成功地应用于高通量和低通量形式，来确定完整膜和膜相关蛋白的相互作用，这些蛋白可来自不同种类的有机生物体中不同功能、结构和亚细胞定位。
③（RET）共振能量传递技术：能够不改变相互蛋白质所依赖的生理环境，能够在生物体内便可对其进行实时生理监测。
④（LUMIER）光标记哺乳动物相互作用组定位技术：LUMIER可以以自动化高通量的方式研究哺乳动物自然环境中的PPI，对今后哺乳动物的信号转导通路的研究是不可或缺的。
⑤（MAPPIT）哺乳动物蛋白质—蛋白质相互作用链和其变异技术 ：MAPPIT在发现新药物和药物作用靶位的分析的中有重要价值。 ⑥噬菌体展示技术：特别适用于快速筛查和优化分子间的相互作用，使其成为药物开发的重要工具。
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